More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4139 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 238 aa  479  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  32.85 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 219 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 214 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  39.11 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  39.3 
 
 		 237 aa  111  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2293  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  hitchhiker  0.00231289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  36.1 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 227 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  32.42 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 225 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 241 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  35.27 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  35.27 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  41.45 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 211 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  34.88 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  34.88 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 239 aa  105  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  37.78 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 212 aa  105  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  30.09 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 216 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 234 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  35.03 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>