More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2293 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2293  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  461  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  hitchhiker  0.00231289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  41.53 
 
 		 263 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  41.53 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  40.98 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  34.6 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 254 aa  124  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 241 aa  124  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  36.87 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  36.14 
 
 		 227 aa  122  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 222 aa  122  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 241 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34.09 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  36.5 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  36.07 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  34.5 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  34.98 
 
 		 223 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 251 aa  108  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 226 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 229 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 284 aa  105  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.11 
 
 		 229 aa  104  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 226 aa  101  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 240 aa  101  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  31.71 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 222 aa  99  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 255 aa  99  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 263 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  31.55 
 
 		 228 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 251 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 231 aa  98.2  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0428  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 222 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 248 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 		 245 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 231 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 232 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 234 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 239 aa  95.5  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  32.97 
 
 		 249 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  34.55 
 
 		 216 aa  95.1  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 234 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 246 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  29.1 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  37.25 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  30.18 
 
 		 231 aa  93.6  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1881  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  31.77 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 254 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  32.64 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>