More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0466 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1245  GntR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 242 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  53.81 
 
 		 221 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 218 aa  142  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  37.67 
 
 		 241 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 251 aa  136  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 242 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6547  GntR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  40.7 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 232 aa  131  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  38.73 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  38.31 
 
 		 263 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  37.09 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0049  GntR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  38.89 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 223 aa  121  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  33.98 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 227 aa  119  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 275 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  36.63 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4019  transcriptional regulator, GntR family  38.86 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4132  transcriptional regulator, GntR family  38.86 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 223 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  38.12 
 
 		 240 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  41.38 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 222 aa  105  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  39.34 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  39.34 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 220 aa  99  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 251 aa  99  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 222 aa  98.2  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 234 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  32.82 
 
 		 212 aa  98.2  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 229 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 211 aa  96.3  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2293  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  hitchhiker  0.00231289 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 219 aa  95.9  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 229 aa  95.5  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  39.41 
 
 		 218 aa  95.1  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 229 aa  95.1  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  35.33 
 
 		 221 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 244 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 226 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 211 aa  92.8  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 222 aa  92.4  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 239 aa  92  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 242 aa  89.7  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 222 aa  89.4  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 226 aa  89.4  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  34.22 
 
 		 216 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 249 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>