More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3484 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  88.29 
 
 		 223 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  71.62 
 
 		 226 aa  315  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  70.35 
 
 		 225 aa  301  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  70.54 
 
 		 230 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  70.09 
 
 		 230 aa  299  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  71.43 
 
 		 225 aa  285  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 229 aa  188  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  49.75 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  50.51 
 
 		 263 aa  181  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  49.75 
 
 		 274 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  45.16 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  43 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  43 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 241 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 229 aa  171  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 254 aa  169  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 228 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 275 aa  167  9e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  44.55 
 
 		 256 aa  165  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 231 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  36.97 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  40.38 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 239 aa  131  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0049  GntR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 245 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4019  transcriptional regulator, GntR family  40.31 
 
 		 255 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4132  transcriptional regulator, GntR family  40.31 
 
 		 295 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  39.69 
 
 		 240 aa  125  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 222 aa  121  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6547  GntR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  40.57 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 233 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 230 aa  118  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1245  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 242 aa  118  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  36.55 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 223 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 223 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2293  GntR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 228 aa  111  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  hitchhiker  0.00231289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  36.45 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 242 aa  108  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 235 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 238 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 220 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.82 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 234 aa  105  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  36.87 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 222 aa  104  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 219 aa  104  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  35.68 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>