More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0062 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  473  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  85.11 
 
 		 235 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  76.6 
 
 		 235 aa  377  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  70.59 
 
 		 229 aa  339  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  70.59 
 
 		 229 aa  338  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  72.73 
 
 		 226 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  66.06 
 
 		 229 aa  298  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  40.31 
 
 		 239 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 232 aa  148  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  36.5 
 
 		 231 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  35.12 
 
 		 223 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  38.73 
 
 		 223 aa  138  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  37.13 
 
 		 233 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  36.22 
 
 		 228 aa  134  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  35.98 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 233 aa  128  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  36.73 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 227 aa  121  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 227 aa  118  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 223 aa  118  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  33.15 
 
 		 269 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  34.58 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  29.47 
 
 		 229 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 255 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  33.83 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 290 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  33.17 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 248 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 241 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 224 aa  111  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  33.66 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  32.83 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  33.99 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  33.99 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 232 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 241 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  28.5 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>