More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1149 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  55.29 
 
 		 239 aa  241  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  54.03 
 
 		 226 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  50.71 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  49.77 
 
 		 221 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 224 aa  203  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 221 aa  201  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  49.01 
 
 		 216 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  48.51 
 
 		 216 aa  198  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  47.57 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  47.57 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  47.52 
 
 		 216 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 218 aa  187  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  47.34 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  48.33 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  41.28 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 226 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  40.57 
 
 		 237 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  40.59 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  42.23 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  45.23 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  41.54 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  39.44 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  40.51 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  40.51 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  38.02 
 
 		 237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 244 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  41.48 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  36.46 
 
 		 248 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 221 aa  141  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 218 aa  141  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 227 aa  137  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  39 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.86 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 248 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  42.05 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 222 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 		 228 aa  124  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  32.81 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 222 aa  121  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  37.57 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  31.92 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  33.81 
 
 		 226 aa  118  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  36.45 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  36.73 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 229 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2296  GntR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 255 aa  111  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.51 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 251 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 275 aa  109  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  34.24 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 267 aa  108  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 235 aa  108  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>