More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4801 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  512  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4792  GntR family transcriptional regulator  50.44 
 
 		 240 aa  201  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.815698  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  39.63 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 240 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 220 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  37.26 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 251 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 244 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 216 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  36.68 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 237 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  36.53 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  36.53 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  31.61 
 
 		 214 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  31.88 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  35.53 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 219 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 221 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  38.54 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 216 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 234 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 226 aa  106  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  31.4 
 
 		 228 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.64 
 
 		 228 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  36.07 
 
 		 223 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  31.75 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2915  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  36.09 
 
 		 216 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 262 aa  101  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 230 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 229 aa  99.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 222 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.21 
 
 		 231 aa  99  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 262 aa  98.6  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 262 aa  98.6  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 212 aa  98.6  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  36.69 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 222 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  28.06 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 226 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 235 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  31.43 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 255 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 258 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 238 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 233 aa  95.5  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 227 aa  95.5  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 223 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 230 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 218 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>