More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6029 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  87.1 
 
 		 218 aa  329  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  68.08 
 
 		 223 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  68.08 
 
 		 223 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  70.37 
 
 		 217 aa  261  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  68.54 
 
 		 223 aa  258  7e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  58.57 
 
 		 224 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  57.77 
 
 		 226 aa  233  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  54.91 
 
 		 239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  55.29 
 
 		 220 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  53.81 
 
 		 216 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  52.86 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  55.61 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 218 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  50.95 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  52.11 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  52.4 
 
 		 221 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  51.46 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  47.62 
 
 		 218 aa  176  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 		 237 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 242 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 222 aa  169  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  47.92 
 
 		 222 aa  168  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  44.81 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  46.97 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  46.97 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  47.94 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  48.72 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  47.26 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  44.23 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  40.49 
 
 		 214 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  41.94 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  45.96 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 221 aa  148  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  44.95 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 234 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  41.08 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4792  GntR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.815698  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 223 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  41.5 
 
 		 219 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 216 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 229 aa  109  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 230 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 233 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2915  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  36.51 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 235 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.41 
 
 		 228 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  39.15 
 
 		 237 aa  105  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0035  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 230 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  34.53 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2293  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  hitchhiker  0.00231289 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 219 aa  102  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 219 aa  102  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  36.56 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  35.5 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  37.17 
 
 		 222 aa  99.4  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 230 aa  99.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 231 aa  98.6  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  37.7 
 
 		 231 aa  99  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 228 aa  98.6  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 234 aa  98.6  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  38.42 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  38.42 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>