More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2915 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2915  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  453  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 239 aa  108  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  32.42 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 229 aa  98.6  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 221 aa  98.2  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 235 aa  96.3  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  33.8 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  37.41 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 241 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  33.52 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 217 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  91.3  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  31.55 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4792  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 240 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.815698  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 231 aa  89.4  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 		 226 aa  89  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 231 aa  89  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 248 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 234 aa  88.6  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  30.66 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 240 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 		 231 aa  85.9  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 231 aa  85.1  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 221 aa  85.1  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.83 
 
 		 237 aa  85.1  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 218 aa  85.1  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  30.52 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  30.46 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 396 aa  82.8  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  30.98 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  29.85 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.97 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.29 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  30.52 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  30.52 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  32.95 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.97 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  32.82 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  29.85 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>