More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4345 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  474  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  61.65 
 
 		 246 aa  244  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  59.81 
 
 		 218 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  59.56 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  42.19 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 226 aa  118  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  40.2 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  37.22 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.29 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 231 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 267 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1449  transcriptional regulator, GntR family  39.27 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.92 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  36.96 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 222 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 209 aa  98.2  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 223 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 229 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  35.94 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  29.6 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 221 aa  95.1  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 242 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 222 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  26.55 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  35.91 
 
 		 233 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1708  transcriptional regulator, GntR family  39.36 
 
 		 212 aa  92.8  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243048 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 221 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 234 aa  92.4  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 227 aa  92.4  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  33.91 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 227 aa  91.7  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  33.91 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  31.1 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  37.99 
 
 		 216 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  33 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  32.44 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 246 aa  89  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 221 aa  89  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4700  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 236 aa  88.6  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.445509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0287  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 220 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 290 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0035  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  35.82 
 
 		 207 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 248 aa  85.9  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  30.33 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 		 212 aa  85.9  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 212 aa  85.5  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1245  GntR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 242 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 229 aa  85.1  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 228 aa  85.1  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 227 aa  85.1  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2014  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 228 aa  85.1  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  33.91 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>