More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2680 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
229 aa  441  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  53.08 
 
 
217 aa  207  9e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  54.37 
 
 
229 aa  202  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
223 aa  148  7e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3363  transcriptional regulator, GntR family  47.47 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  35.86 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 
229 aa  111  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
225 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 
231 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  39.34 
 
 
215 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
231 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
244 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
233 aa  105  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
290 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
211 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 
227 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 
221 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 
239 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
234 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
248 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  32.21 
 
 
239 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 
232 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
223 aa  101  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 
223 aa  101  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  37.11 
 
 
217 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
241 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
233 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 
223 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
240 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
232 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  37.99 
 
 
247 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
223 aa  99.4  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
233 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
219 aa  99.4  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
235 aa  99.4  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 
237 aa  98.2  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
249 aa  97.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1425  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
246 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
218 aa  97.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
234 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
235 aa  96.3  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
268 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
263 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
253 aa  95.9  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  37.02 
 
 
249 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  36.51 
 
 
239 aa  95.5  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
245 aa  95.9  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
212 aa  95.5  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
221 aa  95.5  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 
230 aa  95.5  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
234 aa  95.1  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
247 aa  95.1  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 
232 aa  94.7  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  31 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.79 
 
 
228 aa  94.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  31.55 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  31 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 
262 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 
217 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  28.63 
 
 
252 aa  93.6  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
230 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 
234 aa  92.8  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
241 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
242 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
242 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
255 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
242 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
241 aa  92.8  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3921  transcriptional regulator, GntR family  34.7 
 
 
234 aa  92.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
230 aa  92.4  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
242 aa  92.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
242 aa  92.4  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 
226 aa  92  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
260 aa  91.7  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  32.52 
 
 
259 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  32.52 
 
 
259 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 
230 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
255 aa  90.9  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
227 aa  90.9  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
244 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>