More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0498 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  37.14 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 226 aa  104  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  34.7 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 		 221 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 244 aa  101  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  36.5 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3025  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 222 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  35.11 
 
 		 248 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 		 252 aa  99  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 218 aa  98.6  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 229 aa  98.2  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  32.05 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  31.42 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3081  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  35.1 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 224 aa  95.5  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  95.5  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 240 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 229 aa  94.7  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 265 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 246 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 237 aa  94.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 266 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 235 aa  92.8  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 222 aa  92.4  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 233 aa  92  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 212 aa  91.7  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 217 aa  92  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 227 aa  91.7  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 223 aa  91.7  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  32.39 
 
 		 240 aa  90.9  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3363  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>