More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4656 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 237 aa  475  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  65.8 
 
 		 234 aa  285  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6785  GntR family transcriptional regulator  64.56 
 
 		 234 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  41.74 
 
 		 233 aa  161  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 228 aa  155  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 222 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  33.91 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  34.97 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.96 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 247 aa  99.4  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 235 aa  98.6  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 232 aa  95.5  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 219 aa  95.1  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 240 aa  95.1  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 227 aa  92.8  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 234 aa  92.8  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 227 aa  92  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 226 aa  92.4  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 227 aa  92  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 258 aa  91.7  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  27.49 
 
 		 226 aa  91.7  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  27.45 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 249 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  33.81 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 268 aa  89  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 262 aa  89  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 229 aa  88.6  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  30.05 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  28.96 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2904  transcriptional regulator, GntR family  31.85 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2535  transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0216  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 290 aa  85.9  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 228 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 215 aa  85.9  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 240 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  31.09 
 
 		 235 aa  85.9  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 225 aa  85.5  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 277 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 268 aa  85.5  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 216 aa  85.1  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  29.07 
 
 		 231 aa  85.1  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  28.19 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  25.24 
 
 		 231 aa  85.1  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>