More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3123 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2043  GntR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64820  putative transcriptional regulator  45.59 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00305784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5629  putative transcriptional regulator  46.12 
 
 		 237 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6553  GntR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 233 aa  151  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2906  transcriptional regulator VanR  43.9 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118956  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2710  transcriptional regulator GntR  43.41 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0839086  normal  0.32208 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0345  GntR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0845  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5155  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 273 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2134  GntR family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2168  GntR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3738  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2025  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 244 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  42.25 
 
 		 257 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1295  GntR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6983  GntR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1336  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  38.76 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1907  GntR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.128765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3788  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 238 aa  125  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2185  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  36.28 
 
 		 252 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1351  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4140  transcriptional regulator, GntR family  36.97 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1372  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 242 aa  114  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0535  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  32.29 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  34.43 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  32.13 
 
 		 233 aa  95.5  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 232 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 242 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 267 aa  92.4  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 231 aa  92  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 242 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 242 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 241 aa  88.6  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  35.12 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  32.87 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 223 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 234 aa  85.5  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  31.56 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3959  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 219 aa  85.5  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.426708  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 230 aa  85.1  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 211 aa  85.1  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 247 aa  85.1  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  28.63 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  30.45 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  30.49 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>