More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3788 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3788  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  484  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5629  putative transcriptional regulator  40.17 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64820  putative transcriptional regulator  39.74 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00305784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2168  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2043  GntR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2906  transcriptional regulator VanR  39.82 
 
 		 236 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118956  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1295  GntR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 239 aa  148  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3738  GntR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2025  GntR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0345  GntR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 238 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2710  transcriptional regulator GntR  39.37 
 
 		 236 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0839086  normal  0.32208 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1336  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0845  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 233 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 256 aa  118  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  36.19 
 
 		 257 aa  118  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  36.19 
 
 		 250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4140  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1907  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.128765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  33.64 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1351  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2185  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 251 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6553  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2134  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6983  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 243 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0535  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372585 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5155  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 273 aa  99.8  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 222 aa  89.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 265 aa  85.1  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1372  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  31.73 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  32.49 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  28.63 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  33.78 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3096  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  29.65 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2935  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000424024  hitchhiker  0.000467948 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0200  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  27 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  27.27 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>