More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3643 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 239 aa  464  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 235 aa  207  9e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  50.69 
 
 		 243 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1549  transcriptional regulator, GntR family  45.16 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1921  transcriptional regulator, GntR family  45.67 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2120  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 240 aa  125  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4461  GntR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 230 aa  111  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0240  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00490  transcriptional regulator  36.28 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3552  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 256 aa  99  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 216 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0726  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  28.77 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  34.82 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  35.82 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.89 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  30.58 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  30.08 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  34.58 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4996  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  34.12 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4402  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225327  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0130  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  33.98 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  32.72 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  26.55 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4203  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  32.13 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  27.75 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6375  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.405237  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>