More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2935 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2935  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 223 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000424024  hitchhiker  0.000467948 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4143  GntR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0311  GntR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0628  transcriptional regulator protein  47.62 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3559  transcriptional regulator, GntR family  43.56 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2008  GntR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0561  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.818378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2145  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  35.5 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  28.5 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 241 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  36.6 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  34.38 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  36.22 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3788  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 232 aa  72  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 262 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 262 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  30.18 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4855  GntR domain-containing protein  32.82 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  30.24 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  34.06 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  29.61 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3959  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.426708  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5342  transcriptional regulator, GntR family  32.82 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.912563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1549  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  31.22 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  30.09 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1198  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>