More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0561 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0561  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 242 aa  479  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.818378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2145  transcriptional regulator, GntR family  56.6 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3559  transcriptional regulator, GntR family  47.69 
 
 		 232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4143  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2008  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2935  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000424024  hitchhiker  0.000467948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0628  transcriptional regulator protein  34.78 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0311  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 202 aa  92.4  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 262 aa  85.1  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 262 aa  85.1  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  28.92 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  35.9 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1418  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  29.47 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  28.5 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2823  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.346929  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  31.74 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  29.95 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 220 aa  72  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  27.48 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  31.14 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  30.21 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  26.39 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  29.83 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  26.81 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 265 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  29.33 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2500  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0872238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  27.36 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  30.57 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03369  Transcriptional regulator, GntR family protein  28.92 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  28.23 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0334  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.389251  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1044  transcriptional regulator  25.24 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000547437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0240  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  32.45 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8124  GntR domain protein  28.88 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>