More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0951 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  471  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  81.48 
 
 		 239 aa  347  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  81.02 
 
 		 237 aa  343  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  68.53 
 
 		 237 aa  321  7e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  53.42 
 
 		 239 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  53.6 
 
 		 232 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  52.86 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  52.86 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 240 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  51.79 
 
 		 240 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  54.25 
 
 		 241 aa  221  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 253 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  52.61 
 
 		 229 aa  218  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  50.46 
 
 		 231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  50.93 
 
 		 230 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2823  GntR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 239 aa  214  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.346929  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  53.3 
 
 		 220 aa  214  9e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  51.21 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2500  GntR family transcriptional regulator  52.28 
 
 		 220 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0872238 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1856  transcriptional regulator, GntR family protein  50.71 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 220 aa  205  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1418  GntR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03369  Transcriptional regulator, GntR family protein  48.4 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1663  GntR-like protein  51 
 
 		 218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 262 aa  198  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1819  GntR family transcriptional regulator  50.76 
 
 		 222 aa  198  7e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.418734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 226 aa  198  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 256 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  49.08 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  49.08 
 
 		 255 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  49.08 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  49.08 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  49.08 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  49.08 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 233 aa  187  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 241 aa  187  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  47.94 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0649  GntR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.875188  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 226 aa  112  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 233 aa  111  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  34.13 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  34.13 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 226 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  36.92 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  35.82 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  38.54 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  38.71 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  38.66 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 228 aa  102  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  39.41 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  34.45 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  34.98 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 227 aa  99.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 222 aa  99  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 220 aa  99  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 222 aa  99  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2765  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0487708  normal  0.0102219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  34.38 
 
 		 244 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 214 aa  96.3  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 221 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>