More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3559 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3559  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 232 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0561  transcriptional regulator, GntR family  47.69 
 
 		 242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.818378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2935  transcriptional regulator, GntR family  43.56 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000424024  hitchhiker  0.000467948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2008  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 232 aa  128  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4143  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2145  transcriptional regulator, GntR family  38.12 
 
 		 254 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0311  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 202 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0628  transcriptional regulator protein  38.19 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 219 aa  88.6  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7094  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 262 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 262 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  25.94 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3853  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000435819  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5954  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0377161 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  34.57 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  23.65 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2850  transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 520 aa  68.9  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452612  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0884  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  27.93 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  29.3 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3953  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  27.6 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5261  transcriptional regulator, GntR family  28.84 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4836  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.035326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0257  GntR domain protein  30.54 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 312 aa  65.1  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>