More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6522 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  70.37 
 
 		 251 aa  306  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  64.35 
 
 		 232 aa  275  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  62.33 
 
 		 236 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  60.19 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  62.15 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6383  transcriptional regulator, GntR family  61.11 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.910943 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0217  GntR family transcriptional regulator  59.07 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0238  GntR family transcriptional regulator  59.07 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0670401  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4836  transcriptional regulator, GntR family  45.73 
 
 		 239 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.035326 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  45.83 
 
 		 244 aa  178  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3224  GntR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5269  GntR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1375  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0432264 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7368  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 250 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4113  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7259  transcriptional regulator GntR family  32.24 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5277  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7262  transcriptional regulator GntR family  29.33 
 
 		 229 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09760  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.503807  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 218 aa  98.2  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4833  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 238 aa  98.2  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2114  transcription regulator protein  31.71 
 
 		 243 aa  95.9  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4824  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679029  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 231 aa  94.7  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 231 aa  94.7  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 231 aa  94.7  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 231 aa  94.7  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 231 aa  94.7  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 231 aa  94.7  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 231 aa  94.7  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4772  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100134 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  26.29 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 248 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 263 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 245 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  25.82 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1632  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.592132  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0737  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268562  normal  0.925546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  34.92 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  31.38 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  34.27 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  28.35 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 226 aa  86.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 251 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  34.27 
 
 		 259 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 211 aa  85.5  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 227 aa  85.1  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 243 aa  85.1  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 202 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4275  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1411  GntR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0858429  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0891  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.881973  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5932  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733777  normal  0.0408892 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>