More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3224 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3224  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5269  GntR family transcriptional regulator  95.74 
 
 		 235 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4836  transcriptional regulator, GntR family  48.2 
 
 		 239 aa  214  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.035326 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  44.89 
 
 		 244 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 234 aa  152  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  41 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  36.45 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6383  transcriptional regulator, GntR family  41 
 
 		 234 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.910943 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0238  GntR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0670401  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0217  GntR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1375  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0432264 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  36.68 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09760  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.503807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4113  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2114  transcription regulator protein  29.13 
 
 		 243 aa  101  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 		 212 aa  99.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 216 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7259  transcriptional regulator GntR family  32.84 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4824  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 231 aa  95.5  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679029  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4833  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163458 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 225 aa  93.2  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 223 aa  92.8  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5277  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 253 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4772  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100134 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 216 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0834  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  29.51 
 
 		 226 aa  87  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 226 aa  85.9  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 216 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 223 aa  85.5  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 238 aa  85.5  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0200  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  32.07 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7262  transcriptional regulator GntR family  28.44 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.35 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  30.05 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7368  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  31.49 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  27.09 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2293  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  hitchhiker  0.00231289 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  29.3 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  27.5 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0428  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  27.5 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>