More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1375 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1375  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 243 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0432264 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2114  transcription regulator protein  67.08 
 
 		 243 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4113  GntR family transcriptional regulator  72.77 
 
 		 238 aa  334  7e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09760  GntR family transcriptional regulator  65.55 
 
 		 242 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.503807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4772  transcriptional regulator, GntR family  60.71 
 
 		 235 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100134 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4824  transcriptional regulator, GntR family  60.26 
 
 		 231 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679029  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7368  GntR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 250 aa  207  9e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4833  transcriptional regulator, GntR family  45.83 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163458 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7262  transcriptional regulator GntR family  42.86 
 
 		 229 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5277  transcriptional regulator, GntR family  45.83 
 
 		 238 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7259  transcriptional regulator GntR family  42.73 
 
 		 236 aa  184  9e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  33.89 
 
 		 237 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 236 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6383  transcriptional regulator, GntR family  35.02 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.910943 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0217  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0238  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 225 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0670401  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  30.87 
 
 		 244 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3224  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 241 aa  98.2  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5269  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 212 aa  92.4  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 233 aa  92  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  32 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  29.41 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 228 aa  88.6  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  34.11 
 
 		 209 aa  88.6  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  33.16 
 
 		 259 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  32.63 
 
 		 259 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 229 aa  85.5  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 211 aa  85.5  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  29.28 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  30.37 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0200  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3664  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>