More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3731 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  461  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 227 aa  104  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1632  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.592132  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 224 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 249 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  32.12 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 222 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  38.93 
 
 		 231 aa  99.4  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 226 aa  99.4  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 253 aa  96.3  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 216 aa  95.1  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1411  GntR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0858429  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  38.73 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  34.22 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 237 aa  92.8  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 230 aa  92.4  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 229 aa  92  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 246 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3003  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 216 aa  89  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.88449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 247 aa  89  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 231 aa  89  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 222 aa  88.6  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  36.57 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1375  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0432264 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1109  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 245 aa  85.9  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 241 aa  85.5  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7641  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.587839 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 238 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3321  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 230 aa  85.5  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216307  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  34.81 
 
 		 217 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 233 aa  85.1  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 232 aa  85.5  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 251 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1712  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 204 aa  85.1  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6111  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 235 aa  85.1  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0459  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0399  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1435  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  37.78 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>