More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3327 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  502  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  59.72 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  62.38 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2899  GntR family transcriptional regulator  56.8 
 
 		 241 aa  222  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527875  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  55.19 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1334  GntR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 227 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.164472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3003  GntR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.88449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3277  transcriptional regulator, GntR family  46.15 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  41.35 
 
 		 224 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  35.91 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2587  transcriptional regulator, GntR family  39.81 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0496  transcriptional regulator, GntR family  46.57 
 
 		 218 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5216  transcriptional regulator, GntR family  35.24 
 
 		 234 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293373  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5794  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 216 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.499675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1896  transcriptional regulator, GntR family  43.95 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.280079  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3321  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216307  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1109  GntR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1712  transcriptional regulator, GntR family  38.69 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 223 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4416  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 217 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5325  transcriptional regulator, GntR family  35.11 
 
 		 263 aa  118  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 226 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 226 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  98.6  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 226 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3597  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 222 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7641  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 230 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.587839 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 229 aa  93.2  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 244 aa  91.7  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 226 aa  91.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 223 aa  89  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  28.92 
 
 		 231 aa  85.9  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3461  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18860  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0812431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  25.59 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  26.04 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  35.6 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.12 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  35.6 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14130  transcriptional regulator, GntR family  40.91 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377103  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  37.1 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2875  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0891  GntR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.881973  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  28.89 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>