More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0106 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 225 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14130  transcriptional regulator, GntR family  53.4 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377103  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1526  GntR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.625253  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1526  transcriptional regulator, GntR family  48.11 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000364413 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12050  transcriptional regulator, GntR family  43.7 
 
 		 253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.549361  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2477  transcriptional regulator, GntR family  57.58 
 
 		 214 aa  123  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 264 aa  98.2  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 254 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  95.9  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  29.59 
 
 		 229 aa  91.7  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 235 aa  91.7  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  32.97 
 
 		 232 aa  91.7  9e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1544  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 221 aa  91.7  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.403257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 251 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  23.88 
 
 		 215 aa  88.6  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 239 aa  88.2  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1819  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.418734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1663  GntR-like protein  33.03 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 237 aa  86.3  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 218 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 256 aa  85.9  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  26.53 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.42 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 231 aa  85.5  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.42 
 
 		 229 aa  85.5  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2500  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0872238 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2825  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0997376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0257  GntR domain protein  38.95 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  30.85 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 265 aa  81.6  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  25.41 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  32.29 
 
 		 216 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1418  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0217  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>