More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12050 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12050  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 253 aa  485  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.549361  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14130  transcriptional regulator, GntR family  56.67 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  46.22 
 
 		 225 aa  175  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1526  GntR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.625253  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1526  transcriptional regulator, GntR family  49.39 
 
 		 219 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000364413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 242 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 240 aa  91.7  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.49 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 218 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  27.78 
 
 		 229 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 217 aa  86.3  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  28.38 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  32.75 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2477  transcriptional regulator, GntR family  54.43 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  32.13 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  36.05 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  34.63 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  31.53 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  33.78 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  26.55 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  28.05 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  23.39 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  31.36 
 
 		 222 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 216 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  28.11 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  30.4 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  35.8 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  44.09 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>