More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1526 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1526  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  425  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.625253  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1526  transcriptional regulator, GntR family  86.38 
 
 		 219 aa  334  7.999999999999999e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000364413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  47.64 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14130  transcriptional regulator, GntR family  52.38 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377103  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12050  transcriptional regulator, GntR family  48.95 
 
 		 253 aa  158  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.549361  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2477  transcriptional regulator, GntR family  53.02 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  37.17 
 
 		 238 aa  99  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 217 aa  98.2  8e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 232 aa  94.7  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 225 aa  92.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 243 aa  92  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 249 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  35.83 
 
 		 240 aa  89.4  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  35.83 
 
 		 238 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 254 aa  88.6  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 228 aa  88.6  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 214 aa  88.2  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 255 aa  87.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1663  GntR-like protein  31.46 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 290 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 223 aa  86.3  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1418  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  85.5  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 215 aa  84.7  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2043  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  36.46 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1856  transcriptional regulator, GntR family protein  31.25 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  26.53 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  36.81 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  35.79 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  35.64 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.15 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  34.39 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2500  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0872238 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  31.72 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  33.67 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  31.5 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  31.55 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1544  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.403257  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>