More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3621 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 238 aa  462  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 255 aa  99.4  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  34.56 
 
 		 229 aa  99  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  39.05 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  33.86 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  34.4 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.91 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 211 aa  95.9  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 223 aa  95.5  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  34.57 
 
 		 229 aa  95.1  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4792  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 240 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.815698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  27 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 248 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 221 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.23 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 211 aa  92  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 256 aa  90.9  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  32.73 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  34.35 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1526  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.625253  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 226 aa  89.7  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 216 aa  89  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  29.87 
 
 		 277 aa  89  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  32.33 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.89 
 
 		 230 aa  89  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 224 aa  88.6  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 224 aa  88.6  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  37.32 
 
 		 234 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  32.89 
 
 		 228 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 221 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 223 aa  88.6  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  88.6  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 223 aa  88.6  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 240 aa  88.6  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.82 
 
 		 237 aa  88.2  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.36 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  37.26 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4198  GntR domain protein  32.52 
 
 		 212 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  30.36 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 231 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0783  transcriptional regulator, GntR family  25.58 
 
 		 219 aa  87  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2587  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 212 aa  85.9  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 260 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 230 aa  85.5  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 235 aa  85.5  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  35.85 
 
 		 240 aa  85.1  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 225 aa  85.1  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  30.59 
 
 		 252 aa  85.1  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>