More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6285 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  61.61 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  62.44 
 
 		 231 aa  272  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  62.27 
 
 		 230 aa  270  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  62.27 
 
 		 265 aa  270  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  56.11 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  54.26 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  52.47 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  42.33 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  40.85 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 239 aa  148  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  143  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  35.68 
 
 		 229 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  38.03 
 
 		 240 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  37.67 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  36.24 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  39.91 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 224 aa  134  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  37.12 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  33.03 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 222 aa  115  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.32 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  28.32 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  28.32 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  28.32 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 228 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 		 227 aa  111  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 228 aa  111  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 228 aa  111  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 277 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 228 aa  108  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5061  transcriptional regulator, GntR family  37.26 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000035042  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 226 aa  102  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1681  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1613  transcriptional regulator, GntR family  29.2 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1661  transcriptional regulator, GntR family  29.2 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022131  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1622  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 244 aa  99.8  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1827  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000849458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 231 aa  99.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5133  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4600  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 222 aa  95.1  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3224  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 254 aa  95.1  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0509  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.223436  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2095  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2000  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0767  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.933117  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0582  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 241 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.414159  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0693  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 241 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1647  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 241 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0655  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 257 aa  91.7  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00110649  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1615  transcriptional regulator, GntR family  23.22 
 
 		 230 aa  91.7  9e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000356607  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 241 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 216 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 228 aa  89.4  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0611  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.600848  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 238 aa  89  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5269  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 267 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>