More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0783 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0783  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 219 aa  432  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0794  transcriptional regulator, GntR family  45.66 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.133446  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0790  transcriptional regulator, GntR family  48.37 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 226 aa  89  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 230 aa  87.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  25.58 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  26.57 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  26.94 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  24.59 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  26.06 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  26.52 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  25.49 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  25.68 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  25.26 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  26.18 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2945  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000364354  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  27.92 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0611  GntR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176506  normal  0.0227892 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  30.11 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0790  GntR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  25.62 
 
 		 231 aa  72  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 234 aa  72  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 227 aa  72  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 221 aa  72  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  26.49 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  21.97 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3183  Transcriptional regulators-like protein  35.71 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138815  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  24.1 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  20.63 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  23.83 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7641  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.587839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1628  transcriptional regulator, GntR family  26.9 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>