More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1439 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 238 aa  483  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 228 aa  96.3  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2904  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 216 aa  95.5  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 225 aa  95.1  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 234 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 235 aa  92.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  29.89 
 
 		 223 aa  92.8  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 233 aa  92  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3609  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 219 aa  91.7  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3521  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 227 aa  91.7  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 211 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 245 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0336  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 242 aa  89.4  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 218 aa  89  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 235 aa  89  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 231 aa  88.6  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  27.75 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  29.23 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  25.95 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  26.37 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 238 aa  85.5  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 223 aa  85.1  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  27.6 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.32 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  27.98 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0130  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0104  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0114  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0123  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  normal  0.0318508 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  27.69 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  29.85 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3134  regulatory protein GntR HTH  27.55 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  27.55 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2517  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  26.4 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  26.56 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1741  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00122783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0783  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1760  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298302  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1807  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0860  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1038  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  26.49 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2339  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 280 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 239 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0607  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0421705  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1124  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3081  GntR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>