More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4468 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  39.82 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  39.74 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 238 aa  148  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 265 aa  148  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  38.91 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  40.27 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  37.74 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  37.26 
 
 		 239 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  36.7 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  35.78 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  38.94 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 239 aa  132  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  35.78 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  36.2 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  40.51 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  40.72 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  40.72 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  40.1 
 
 		 257 aa  128  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  39.07 
 
 		 242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  32.12 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 232 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  35.78 
 
 		 231 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 248 aa  118  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  37.17 
 
 		 265 aa  118  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  32.72 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0655  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00110649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  32.72 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.87 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  34.87 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  34.36 
 
 		 228 aa  111  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 244 aa  111  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  34.1 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1615  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000356607  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 225 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1622  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1827  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000849458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1681  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1613  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1661  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022131  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5061  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000035042  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2043  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000225663  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  29.78 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 254 aa  95.5  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 241 aa  92  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 234 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 233 aa  91.7  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5133  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 260 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 235 aa  89  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>