More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0535 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  56.11 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  55.91 
 
 		 230 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  55.91 
 
 		 265 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  50.45 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  53.6 
 
 		 231 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  48.18 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  49.78 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 234 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  44.13 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  44.13 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 240 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  39.15 
 
 		 241 aa  138  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  38.25 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  35.98 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  35.78 
 
 		 229 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 232 aa  128  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  35.59 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 224 aa  125  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 230 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 222 aa  123  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 284 aa  121  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 226 aa  114  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  34.68 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  30.66 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 228 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.6 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  27.6 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  27.6 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  27.6 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  27.15 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 228 aa  106  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2043  transcriptional regulator, GntR family  25.73 
 
 		 235 aa  105  9e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000225663  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  23.89 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1827  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000849458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1661  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022131  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1681  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1613  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1622  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5061  transcriptional regulator, GntR family  37.79 
 
 		 236 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000035042  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0655  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 257 aa  92.8  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00110649  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5133  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4600  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 245 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 234 aa  91.7  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  32.81 
 
 		 227 aa  91.7  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0509  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 255 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.223436  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  29.23 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0767  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.933117  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4702  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0582  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.414159  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0693  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2095  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2000  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1647  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1615  transcriptional regulator, GntR family  21.76 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000356607  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 290 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>