More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2107 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  496  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  34.29 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 228 aa  125  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 228 aa  122  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 228 aa  121  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 237 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  28.97 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  36.28 
 
 		 239 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 241 aa  108  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 223 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 264 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.1 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  27.1 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  27.1 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  27.1 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 229 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  29.81 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 228 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 228 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 239 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  27.63 
 
 		 234 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1827  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 228 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000849458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  30.45 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 234 aa  99  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1622  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 228 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1613  transcriptional regulator, GntR family  27.1 
 
 		 228 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 224 aa  99  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 230 aa  98.2  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1681  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 228 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1661  transcriptional regulator, GntR family  27.1 
 
 		 228 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022131  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  25.34 
 
 		 227 aa  97.1  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 238 aa  95.1  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 225 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0655  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00110649  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  35.07 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.21 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 219 aa  92.4  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  31.79 
 
 		 232 aa  92.4  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  28.37 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 254 aa  92  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 240 aa  91.7  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5133  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4600  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  28.94 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  27.72 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>