More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2127 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
257 aa  507  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  58.05 
 
 
237 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5061  transcriptional regulator, GntR family  61.74 
 
 
236 aa  242  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000035042  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  51.32 
 
 
241 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  53.24 
 
 
242 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
230 aa  145  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
227 aa  142  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  39.11 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  36.19 
 
 
231 aa  131  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 
277 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
228 aa  128  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  34.68 
 
 
228 aa  128  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  42.33 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
228 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  33.78 
 
 
228 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
228 aa  126  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
228 aa  125  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 
234 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
237 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.35 
 
 
228 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 
228 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
228 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 
228 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
228 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
228 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  36.53 
 
 
265 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  35.35 
 
 
228 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  36.53 
 
 
230 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  35.02 
 
 
239 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  32.58 
 
 
232 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 
264 aa  122  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  35.51 
 
 
239 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
257 aa  122  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  35.02 
 
 
239 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  35.21 
 
 
228 aa  121  9e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  35.51 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 
225 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
227 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  38.58 
 
 
234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  36.92 
 
 
231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 
234 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 
240 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  34.27 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
239 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 
234 aa  115  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0767  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
255 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.933117  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0509  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
255 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.223436  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 
234 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0582  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.414159  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0693  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2095  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2000  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1647  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 
225 aa  112  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
226 aa  112  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1622  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1661  transcriptional regulator, GntR family  34.11 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022131  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1613  transcriptional regulator, GntR family  34.11 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419265  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1681  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1827  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000849458  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
238 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4600  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
245 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  29.22 
 
 
227 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5133  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
243 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
238 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
238 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
238 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
222 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1615  transcriptional regulator, GntR family  25.56 
 
 
230 aa  104  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000356607  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
284 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
264 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0843233  normal  0.231576 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
255 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
226 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
244 aa  98.6  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
214 aa  95.1  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
214 aa  94.7  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4702  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
230 aa  92.4  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0655  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 
257 aa  90.5  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00110649  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  34.9 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 
219 aa  89.7  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2043  transcriptional regulator, GntR family  24.39 
 
 
235 aa  86.3  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000225663  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 
218 aa  85.5  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  23.74 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
255 aa  82  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
226 aa  82  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>