More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1711 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  495  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  78.78 
 
 		 265 aa  362  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  57.34 
 
 		 228 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  44.7 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  42.92 
 
 		 239 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  40.28 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  39.63 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 		 277 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  36.19 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  36.65 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 265 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  31.8 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  32.26 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  36.54 
 
 		 242 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  33.78 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 228 aa  118  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  34.56 
 
 		 231 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 229 aa  115  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 229 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 212 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 235 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 245 aa  105  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 238 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 238 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 239 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.73 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  30.73 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0509  GntR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.223436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  35.57 
 
 		 233 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 244 aa  101  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5133  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 243 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4600  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2095  GntR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2000  GntR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0767  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.933117  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  34.58 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 231 aa  99.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0582  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 241 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.414159  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0693  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 241 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1647  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 241 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 226 aa  98.6  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 230 aa  98.6  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 227 aa  97.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 235 aa  97.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 240 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>