More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5406 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 239 aa  480  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  95.4 
 
 		 239 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 238 aa  168  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 265 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  42.06 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  42.33 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  39.44 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  39.91 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  39.81 
 
 		 234 aa  144  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 229 aa  138  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  37.33 
 
 		 237 aa  128  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  37.02 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  35.02 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  31.39 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 224 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  30.66 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  34.1 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 244 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  30.88 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  30.95 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 265 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0655  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00110649  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 228 aa  99  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 241 aa  98.2  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  26.17 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  24.77 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  27.95 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  28.97 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 228 aa  95.1  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2043  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000225663  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 228 aa  92.4  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  27.57 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 284 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 290 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.9 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  28.9 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1622  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0509  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.223436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2095  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2000  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0767  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.933117  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1615  transcriptional regulator, GntR family  25.6 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000356607  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0582  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.414159  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1647  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0693  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162672  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1827  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000849458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1661  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022131  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1681  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1613  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419265  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  27.57 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5061  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000035042  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  26.64 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3145  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5133  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4600  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4702  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>