More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1861 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  530  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 228 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.63 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  33.63 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  39.22 
 
 		 229 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0509  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 255 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.223436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0767  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.933117  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 229 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  38.74 
 
 		 265 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 227 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2095  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 241 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2000  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 241 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  29.6 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1647  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0582  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.414159  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0693  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162672  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 237 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  35.1 
 
 		 241 aa  125  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 265 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1613  transcriptional regulator, GntR family  34.08 
 
 		 228 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  32.56 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1622  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1827  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000849458  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1681  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 228 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  31.43 
 
 		 234 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1661  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 		 228 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022131  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 277 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  36.55 
 
 		 234 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5133  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4600  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 222 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  30.28 
 
 		 234 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 237 aa  109  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  35.22 
 
 		 239 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 238 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 230 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 240 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  28.1 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  30.45 
 
 		 239 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 225 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  27.7 
 
 		 225 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 240 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 238 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 232 aa  95.5  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 231 aa  95.5  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 223 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 226 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 227 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 225 aa  92.4  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 255 aa  92  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 212 aa  91.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 214 aa  90.5  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 216 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>