More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6647 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  453  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 251 aa  158  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  44.93 
 
 		 223 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  41.04 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 240 aa  151  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 231 aa  148  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  42.78 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  38.54 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  38.54 
 
 		 216 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 217 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  42.13 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  42.13 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  41.71 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  41.71 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  39.9 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4792  GntR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 240 aa  138  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.815698  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  39.02 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  35.12 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  44.55 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  40.58 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  36.65 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  40.95 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  38.66 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 229 aa  121  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 238 aa  118  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  34.93 
 
 		 218 aa  118  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  37.23 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 254 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34.38 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 245 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  39.06 
 
 		 223 aa  108  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 214 aa  106  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  36.53 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2915  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 222 aa  101  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 237 aa  101  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 211 aa  99.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 224 aa  99  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2765  transcriptional regulator, GntR family  34.23 
 
 		 238 aa  99  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0487708  normal  0.0102219 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 250 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 250 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  37.43 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 234 aa  95.9  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 250 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 211 aa  95.9  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 232 aa  95.5  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 233 aa  95.5  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 222 aa  95.5  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  34.45 
 
 		 239 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>