More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2413 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  93.28 
 
 		 238 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  93.28 
 
 		 238 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  57.58 
 
 		 231 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 228 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 239 aa  141  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.12 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  37.12 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  37.12 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  37.12 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  36.68 
 
 		 228 aa  138  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  38.7 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  38.03 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1681  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1661  transcriptional regulator, GntR family  37.12 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022131  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1827  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000849458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1622  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1613  transcriptional regulator, GntR family  36.68 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 248 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  31.11 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  36.94 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  33.8 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 230 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 		 227 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 261 aa  101  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  32.89 
 
 		 265 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.61 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0843233  normal  0.231576 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2043  transcriptional regulator, GntR family  25.86 
 
 		 235 aa  99  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000225663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  30.52 
 
 		 240 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  30.52 
 
 		 240 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  32.55 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 234 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3272  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 236 aa  95.5  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 238 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 225 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1007  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.511541  hitchhiker  0.00101659 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  29.58 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  24.35 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  29.11 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 249 aa  89.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 229 aa  89  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 255 aa  89  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  27.98 
 
 		 225 aa  88.6  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5133  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 243 aa  88.6  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 241 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>