More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0208 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  450  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  54.63 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  54.37 
 
 		 229 aa  202  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3363  transcriptional regulator, GntR family  45.5 
 
 		 218 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 223 aa  138  6e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  37.69 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3921  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 234 aa  111  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0394  transcriptional regulator, GntR family  38.5 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.143272  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  35.1 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  36.95 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  36.82 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  32.23 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37.32 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  36.45 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 290 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  36.54 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  35.18 
 
 		 232 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  36.54 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 238 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  35.03 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 241 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 267 aa  101  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  36.1 
 
 		 227 aa  102  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 254 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  34.33 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  33.49 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 233 aa  99.8  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 233 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 233 aa  98.6  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 252 aa  98.2  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 233 aa  98.2  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1007  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.511541  hitchhiker  0.00101659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 239 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  32.76 
 
 		 254 aa  96.3  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  36.82 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 266 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 223 aa  95.9  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 223 aa  95.9  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 222 aa  95.5  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1158  transcriptional regulator, GntR family  35.51 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1379  transcriptional regulator, GntR family  35.07 
 
 		 227 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 219 aa  95.1  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 219 aa  95.5  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1218  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 250 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 231 aa  94.7  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 		 227 aa  95.1  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 255 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  36.18 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0205  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 268 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1267  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  35.82 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0184  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 228 aa  92.8  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>