More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3921 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3921  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 217 aa  125  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  30.66 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3363  transcriptional regulator, GntR family  35.5 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 237 aa  92  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 290 aa  91.7  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 232 aa  89.4  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  31.05 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 254 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  33.5 
 
 		 259 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  33.5 
 
 		 259 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 226 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0459  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  34.2 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0399  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1267  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3339  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4065  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2823  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.346929  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  33.03 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1007  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.511541  hitchhiker  0.00101659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2161  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0737  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268562  normal  0.925546 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2921  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  28.8 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  31.65 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3664  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6280  transcriptional regulator GntR family  30.77 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3272  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3638  hypothetical protein  39.84 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0069  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2549  GntR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000803432  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0428  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1364  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>