More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3784 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  54.03 
 
 		 233 aa  213  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  45.23 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 290 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 232 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 235 aa  99.4  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  37.22 
 
 		 222 aa  99  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 226 aa  98.6  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 231 aa  98.6  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 222 aa  98.2  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 235 aa  96.7  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  31.11 
 
 		 233 aa  95.5  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 232 aa  95.9  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  30.46 
 
 		 226 aa  95.1  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 228 aa  95.1  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 226 aa  94.7  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.01 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 245 aa  92.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  30.26 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 227 aa  92  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 231 aa  92  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1812  transcriptional regulator, GntR family  29.23 
 
 		 248 aa  91.7  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.515993  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 214 aa  92  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 257 aa  91.7  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  30.52 
 
 		 231 aa  91.7  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 226 aa  91.7  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  34.9 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 260 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 261 aa  89.7  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6417  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 246 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5547  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 246 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5912  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 246 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 244 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  40.31 
 
 		 215 aa  89  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 222 aa  88.6  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 229 aa  88.6  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  32.35 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1364  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 252 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  29.57 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 264 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>