More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5168 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 234 aa  481  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  36.49 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 227 aa  108  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1044  transcriptional regulator  32.72 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000547437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 233 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0179  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8629  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3595  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 220 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  32.27 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  29.33 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 227 aa  88.6  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 227 aa  88.2  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  28.76 
 
 		 239 aa  88.2  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2570  transcriptional regulator  34.9 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.565298  hitchhiker  0.000000111966 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  26.22 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0240  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  27.05 
 
 		 223 aa  86.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 216 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 252 aa  86.3  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 235 aa  85.5  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 230 aa  85.5  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 228 aa  85.5  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 225 aa  85.5  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 222 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  27.56 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  27.37 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1741  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00122783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1760  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298302  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1807  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  30.28 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  27.37 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2765  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0487708  normal  0.0102219 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  32.86 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  23.76 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1907  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.128765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>