More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0297 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 220 aa  447  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 231 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 239 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 223 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0110  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  38.69 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 231 aa  98.6  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 262 aa  98.2  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 262 aa  98.2  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0240  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 238 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 234 aa  96.7  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 262 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  34.34 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 250 aa  96.7  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 227 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  95.5  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 247 aa  95.5  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 255 aa  94.4  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 255 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  28.91 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 244 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 231 aa  92.8  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  32.57 
 
 		 232 aa  92.4  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1435  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 217 aa  92  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 212 aa  92  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 235 aa  91.7  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 252 aa  91.3  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1244  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 239 aa  90.1  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  28.72 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 242 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 254 aa  89.4  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 266 aa  89.4  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  30.35 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 237 aa  89  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 224 aa  88.6  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 224 aa  88.6  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.55 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 232 aa  88.6  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 216 aa  88.6  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 234 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3649  GntR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0460435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 231 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 233 aa  85.9  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>