More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1104 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
266 aa  536  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  54.59 
 
 
240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  53.67 
 
 
239 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  50.9 
 
 
236 aa  219  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  50.46 
 
 
255 aa  219  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  48.52 
 
 
254 aa  214  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  48.09 
 
 
247 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  50.23 
 
 
228 aa  208  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  50.22 
 
 
262 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  49.77 
 
 
228 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  47.52 
 
 
262 aa  202  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  48.6 
 
 
252 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  47.66 
 
 
252 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  44.35 
 
 
233 aa  195  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  46.76 
 
 
246 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
312 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
260 aa  168  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 
238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
254 aa  112  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 
231 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 
239 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
233 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
243 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
233 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
233 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 
223 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
233 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 
239 aa  96.3  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  33.06 
 
 
243 aa  95.9  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
236 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  33.33 
 
 
205 aa  90.1  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
245 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  34.9 
 
 
257 aa  90.1  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 
262 aa  89.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 
220 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
227 aa  89.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
243 aa  89  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 
246 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 
229 aa  87  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 
255 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
246 aa  86.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
235 aa  85.5  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 
223 aa  85.9  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
238 aa  85.5  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
222 aa  85.1  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  27.45 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  29.31 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
219 aa  84  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  29.05 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
221 aa  82  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  29.95 
 
 
240 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  29.95 
 
 
240 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  27.5 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
216 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  27.5 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 
209 aa  79  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
256 aa  79  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  27.36 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
233 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>