More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3577 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  484  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  68.28 
 
 		 250 aa  330  8e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 227 aa  118  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  34.34 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37.07 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 235 aa  101  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 227 aa  99  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 233 aa  99  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 231 aa  98.6  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 232 aa  98.6  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 229 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 263 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 250 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  30.21 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4561  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  31.31 
 
 		 263 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 		 226 aa  95.5  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 248 aa  95.1  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 230 aa  95.1  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 255 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 246 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  27.41 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 274 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  31.19 
 
 		 227 aa  92  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  27.04 
 
 		 230 aa  92  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 227 aa  92  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 231 aa  91.7  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 233 aa  91.7  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 233 aa  91.7  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 233 aa  91.7  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 284 aa  90.9  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 242 aa  90.9  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 251 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0035  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 230 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  28.36 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 237 aa  89.4  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 224 aa  89  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 239 aa  89  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 224 aa  89  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 250 aa  89  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 237 aa  88.6  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  29.26 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  30.21 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>