More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1435 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1435  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 230 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1411  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0858429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1632  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.592132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 223 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 220 aa  92.4  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.07 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5188  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 216 aa  89  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948488  normal  0.0144297 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 230 aa  88.2  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4461  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1411  transcriptional regulator, GntR family  27.45 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1961  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 227 aa  86.3  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0634218  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1887  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000514659  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2535  transcriptional regulator, GntR family  30.86 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 255 aa  85.5  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0240  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 228 aa  85.5  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3337  transcriptional regulator, GntR family  25.48 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0218222  normal  0.194173 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.89 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 243 aa  81.6  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2036  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00223971  normal  0.0618137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2728  transcriptional regulator, GntR family  25.34 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.246809  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  29.35 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  27.68 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  27.68 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  26.6 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1096  transcriptional regulator, putative  27.42 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2549  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000803432  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0336  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  27.01 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2823  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.346929  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  27.98 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  27.36 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  26.88 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  27.81 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  29.89 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  28.06 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  25.67 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  27.86 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7701  transcriptional regulator, GntR family  25.93 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788387  normal  0.631599 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>