More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2535 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2535  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 219 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1411  transcriptional regulator, GntR family  50.49 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1632  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.592132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1411  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 223 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0858429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 223 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 229 aa  98.6  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 241 aa  98.6  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34.2 
 
 		 238 aa  98.2  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1435  transcriptional regulator, GntR family  28.84 
 
 		 230 aa  97.4  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  35.55 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  36.31 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 229 aa  95.1  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 231 aa  95.1  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 237 aa  93.2  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.71 
 
 		 228 aa  92.4  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 229 aa  92  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 		 252 aa  91.7  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 254 aa  90.9  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5188  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948488  normal  0.0144297 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 227 aa  88.6  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.6 
 
 		 226 aa  86.7  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 251 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 239 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 241 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 226 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3183  Transcriptional regulators-like protein  39.66 
 
 		 242 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138815  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  32.57 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 226 aa  85.1  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  33.14 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7259  transcriptional regulator GntR family  30 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2728  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.246809  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2036  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00223971  normal  0.0618137 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4833  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 275 aa  81.6  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  22.79 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6785  GntR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4198  GntR domain protein  35.44 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  36.1 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5277  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6204  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  29.11 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0238  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0670401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>